倒塌的农村房屋可以申请确权，农村房屋倒塌后，利害关系人可以提供宅基地使用证明、村委会证明等材料，申请房屋确权。因物权的归属、内容发生争议的，利害关系人可以请求确认权利。所以倒塌农村房屋可以申请确权的，利害关系人可以提供相关材料，向土地管理部门或者人民申请确权。
法律依据：
《中华人民共和国民法典》
第二百三十三条 物权受到侵害的，权利人可以通过和解、调解、仲裁、诉讼等途径解决。
第二百三十四条 因物权的归属、内容发生争议的，利害关系人可以请求确认权利。
第三百六十四条 宅基地因自然灾害等原因灭失的，宅基地使用权消灭。对失去宅基地的村民，应当依法重新分配宅基地。