法律分析：在有债权凭证作为借款合同关系发生的主要证据时，一般可以认定出借人和借款人之间存在民间借贷法律关系，并可以推定出借人实际履行了款项交付义务。但是，如果被告提出借款已经归还的主张，则首先需要由被告提供相应证据证明这一主张。
法律依据：《最高人民关于审理民间借贷案件适用法律若干问题的规定》第十五条
原告仅依据借据、收据、欠条等债权凭证提起民间借贷诉讼，被告抗辩已经偿还借款的，被告应当对其主张提供证据证明。被告提供相应证据证明其主张后，原告仍应就借贷关系的存续承担举证责任。
被告抗辩借贷行为尚未实际发生并能作出合理说明的，人民应当结合借贷金额、款项交付、当事人的经济能力、当地或者当事人之间的交易方式、交易习惯、当事人财产变动情况以及证人证言等事实和因素，综合判断查证借贷事实是否发生。